Identıfıcatıon of the genomıc regıons assocıated wıth the orobanche (orobanche cumana wall.) and downy mıldew (plasmopara halstedii (farl.) berlese & de toni) resıstance ın sunflower (helianthus annuus l.) usıng gwas
| dc.contributor.advisor | Şakiroğlu, Muhammet | |
| dc.contributor.author | Yastı, Özlem Gül | |
| dc.date.accessioned | 2026-05-09T09:20:54Z | |
| dc.date.available | 2026-05-09T09:20:54Z | |
| dc.date.issued | 2026 | |
| dc.department | Enstitüler, Lisansüstü Eğitim Enstitüsü, Biyomühendislik Ana Bilim Dalı | |
| dc.description | Lisansüstü Eğitim Enstitüsü, Biyomühendislik Ana Bilim Dalı | |
| dc.description | Embargoed Access: 26.08.2026 tarihine kadar kullanımı yazar tarafından kısıtlanmıştır. | |
| dc.description.abstract | Sunflower (Helianthus annuus L.) is the third most widely grown oilseed worldwide, the production concentrated in Ukraine, Russia, Argentina, Türkiye, Romania, and USA. Due to global demand for sunflowers, there is an increase in cultivation of sunflowers. Nonetheless, sunflower production is affected by abiotic and biotic stress factors. Particularly, the parasite plant orobanche and fungus downy mildew are the two major biotic stress factors that could cause serious losses in sunflower production. Various control methods such as chemical, mechanical, biological, cultural, etc. are used to cope with these two problems. Due to the speed proliferation of the two, the traditional methods are insufficient to provide sustainable and environmentally friendly solutions. Therefore, it is necessary to use combinations of classical breeding and genomic approaches to identify genetic bases of resistance and incorporate these into breeding programs to achieve long-term resistance to orobanche and downy mildew. Genome-wide association studies (GWAS) are powerful methods to detect genomic regions controlling the traits of interest in crops and have not been used extensively for identification of genomic regions controlling orobanche and downy mildew. In this study, the genomic regions associated with the resistance to orobanche, and downy mildew were assessed using GWAS approach and several regions were detected. Post GWAS analyses revealed several candidate genes including LOC110865598 for orobanche and LOC110917551 for mildew. Further studies could be performed to confirm the candidate genes and incorporate these into breeding programs. | |
| dc.description.abstract | Ayçiçeği (Helianthus annuus L.), üretimi Ukrayna, Rusya, Arjantin, Türkiye, Romanya ve ABD'de yoğunlaşmış, dünya çapında en çok yetiştirilen üçüncü yağlı tohumdur. Ayçiçeğine olan küresel talepten dolayı ayçiçeği yetiştiriciliği artmaktadır. Bununla birlikte, ayçiçeği üretimi abiyotik ve biyotik stres faktörlerinden etkilenmektedir. Özellikle parazitik bitki Orobanş ve fungus hastalığı mildiyö, ayçiçeği üretiminde ciddi kayıplara neden olabilecek iki önemli biyotik stres faktörüdür. Bu iki problemle başa çıkmak için kimyasal, mekanik, biyolojik, kültürel vb. gibi çeşitli kontrol yöntemleri kullanılmaktadır. Her iki hastalığında hızla yaygınlaşması nedeniyle, geleneksel yöntemler sürdürülebilir ve çevre dostu çözümler sunmakta yetersiz kalmaktadır. Bu nedenle, Orobanş ve mildiyö hastalığına karşı uzun vadeli dayanıklılık elde etmek için, dayanıklılığın genetik temellerini belirlemek ve bunları ıslah programlarına dahil etmek amacıyla klasik ıslah ve genomik yaklaşımların kombinasyonlarının kullanılması gerekmektedir. Genom çapında ilişkilendirme çalışmaları (GWAS), mahsullerde ilgi çekici özellikleri kontrol eden genom bölgelerini tespit etmek için güçlü yöntemlerdir ve Orobanş ve mildiyö'yü kontrol eden genom bölgelerinin belirlenmesinde yaygın olarak kullanılmamıştır. Bu çalışmada, Orobanş ve mildiyö'ye karşı direnç durumu ve her iki hastalığa karşı direnci kontrol eden genom bölgelerinin belirlenmesine yönelik GWAS yaklaşımı kullanılmıştır. Her iki biyotik faktöre direnç ile ilgili olduğu belirlenen farklı genomik bölgeler bulunmuş olup GWAS sonrası analizlerle aday genler bulunmuştur. Bu aday genlerin teyidi ve ıslah çalışmalarında kullanımı için yeni çalışmaların hayata geçirilmesi önerilmektedir. | |
| dc.identifier.endpage | ? | |
| dc.identifier.startpage | 1 | |
| dc.identifier.uri | https://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/tezSorguSonucYeni.jsp | |
| dc.identifier.uri | https://hdl.handle.net/20.500.14669/3449 | |
| dc.identifier.yoktezid | 1001201 | |
| dc.language.iso | en | |
| dc.publisher | Adana Alparslan Türkeş Bilim ve Teknoloji Üniversitesi | |
| dc.relation.publicationcategory | Tez | |
| dc.rights | info:eu-repo/semantics/embargoedAccess | |
| dc.snmz | KA_20241211 | |
| dc.subject | Biyomühendislik | |
| dc.subject | Bioengineering | |
| dc.title | Identıfıcatıon of the genomıc regıons assocıated wıth the orobanche (orobanche cumana wall.) and downy mıldew (plasmopara halstedii (farl.) berlese & de toni) resıstance ın sunflower (helianthus annuus l.) usıng gwas | |
| dc.title.alternative | Ayçi̇çeği̇nde (helianthus annuus l.) orobanş (orobanche cumana wall.) ve mi̇ldi̇yö (plasmopara halstedii (farl.) berlese & de toni) direnci ile i̇li̇şki̇li̇ genomi̇k bölgelerin gwas kullanilarak tanimlanmasi | |
| dc.type | Master Thesis |
