Kanser hücrelerini 3-boyutlu görüntüleyebilen yapay zekâ temelli robotik mini-opto biyotomografi cihazı için 3-boyutlu görüntüleme yazılımı geliştirme
[ X ]
Tarih
2020
Yazarlar
Dergi Başlığı
Dergi ISSN
Cilt Başlığı
Yayıncı
Erişim Hakkı
info:eu-repo/semantics/openAccess
Özet
Çesitli türleri bulunan kanser, günümüzde en yaygın ve en ölümcül hastalıkların basında gelmektedir. Kanseri yenmek için gen ve doku mühendisligi alanında hücresel boyutlarda çesitli çalısmalar yapılmaktadır. Kanserin erken teshisi, hastalıgın tedavisinde çok önemli yer tutmaktadır. Bu kapsamda hem bilimsel arastırmalar seviyesinde hem de hastanelerde tanı, teshis ve tedavi uygulama noktasında kanserle mücadele edilmektedir. Görüntüleme, hastada kanseri erken teshis etmek için kullanılan en önemli yöntemlerden biri oldugu gibi aynı zamanda kanser üzerine yapılan bilimsel çalısmaların performansını da ölçen güçlü bir yöntemdir. Organ düzeyindeki görüntüleme araçları arasında MR (magnetic resonans), PET (positron emission tomography), CT (computed tomography), DBT (digital breast tomosynthesis), mammografi gibi cihazlar sayılırken hücre düzeyindeki görüntüleme araçlarından yaygın olarak kullanılanlarından biri mikroskop sayılabilir. CT ve DBT gibi organ görüntüleyen cihazlarda görüntüleme metodu olarak genellikle FBP (filtered back projection) metodu kullanılmaktadır. Çesitli arastırmalarda ve klinik uygulamalarda hücre görüntüleme için hâlihazırda kullanılan mikroskop çesitleri arasında konfokal mikroskop, elektron mikroskobu ve floresan mikroskop bulunmaktadır. Elektron ve floresan mikroskoplarla 2-boyutlu görüntüleme yapılabilirken, konfokal mikroskopla 3-boyutlu stereo görüntüleme yapılabilmektedir. Ancak konfokal mikroskop, kullanımı uzmanlık isteyen, tasınması kolay olmayan ve çok pahalı bir cihaz oldugundan arastırma laboratuvarlarında yaygın olarak bulunamamaktadır. Bu proje kapsamında; konfokal mikroskopa alternatif olarak kullanımı kolay, tasınabilir ve pahalı olmayan, kanser hücrelerini açısal tarama ile 3-boyutlu görüntüleyebilen yapay zekâ temelli robotik mini-opto biyotomografi cihazı için 3-boyutlu ileri görüntüleme yazılımı gelistirilmistir. Bu projenin nihai çıktısı olarak; parametreleri ve geometrisi 800x800x50 boyutlarında katmanlar halinde 3B görüntü geri çatabilen bir iteratif görüntü geri çatma yazılımı (Algebraic reconstruction techniques + 3-dimensional total variation: ART+TV3D) Matlab ortamında gelistirilmistir.
Açıklama
15.07.2020
Anahtar Kelimeler
Art, tv, miniopto tomografi platform, konfokal mikroskop, 3b görüntüleme, iteratif görüntü geriçatma
