Yazar "Ünal, Ülkü" seçeneğine göre listele

Listeleniyor 1 - 1 / 1
  • [ X ]
    Öğe
    Drug repurposing in colorectal cancer by using transcriptomic data
    (Adana Alparslan Türkeş Bilim ve Teknoloji Üniversitesi, 2021) Ünal, Ülkü; Göv, Esra
    Kolorektal kanser (KRK), dünya çapında insanların maruz kaldığı en ölümcül kanser türlerinden biridir. Bu çalışmada, ilaç yeniden kullanımı (ilaç reposisyonu) olarak bilinen çok popüler bir yaklaşım ve hesaplamalı biyoloji yöntemleri ile KRK tedavisinde kullanılabilecek aday ilaçları ortaya çıkarmayı amaçladık. İlk olarak, transkriptomik verilerin analiziyle KRK'de ifadesi farklılaşan genler tanımlandı. Daha sonra, farklılaşarak birlikte ifade edilen gen modülleri tanımlandı ve bu modül genlerinin CRC'deki prognostik önemi gösterildi. Son olarak ortaya çıkardığımız gen modüllerine dayanarak, KRK'nin seyrini değiştirebilecek tedavi adayları belirlendi. Bu adaylar, tümör büyümesi üzerindeki etkilerini göstermek için deneysel/klinik çalışmalarda incelenen veya KRK tedavisinde orijinal olarak kullanılmayan/incelenmeyen ilaçları veya küçük molekülleri içerir. Çalışmamızda, yirmi iki genden oluşan KRK'de yeni, farklı şekilde birlikte ifade edilmiş, yüksek oranda birbirine bağlı ve birlikte düzenlenmiş prognostik bir gen modülü ortaya çıkardık. Gallik asit, valinomisin, sisteamin, AZD8055, BRD-K81473043, tirfostin AG1478, BRD-A17065207, dovitinib, trametinib, HDAC6 inhibitor ISOX, AS605240, 480743.cdx, BRD-K03829970, L-6307 ve NVP-TAE684'den oluşan on beş adet ilaç veya molekülü KRK için yeniden kullanım adayı olarak öneriyoruz. HDAC6 inhibitor ISOX, AS605240, 480743.cdx, BRD-K03829970, L6307 ve NVP-TAE684'ü CRC tümörijenezi üzerindeki anti-kanserojen etkileri araştırılmamış yeni yeniden kullanım adayları olarak sunuyoruz. Bulgularımızın klinik olarak araştırılması, KRK için yeni tedavi seçenekleri oluşturması açısından önemlidir. Anahtar Kelimeler: kolorektal kanser, ilaç yeniden kullanımı, transkriptomik veri