Yazar "Özdemir, Meryem Damla" seçeneğine göre listele

Listeleniyor 1 - 2 / 2
  • [ X ]
    Öğe
    Cloning of the glucoamylase encoding gene found in aspergillus niger genome
    (Adana Alparslan Türkeş Bilim ve Teknoloji Üniversitesi, 2019) Özdemir, Meryem Damla; Göktürk, Dilek
    Glukoamilaz (GA), glikoz gereken her prosesin hidroliz basamağına katılan bir ekzoenzimdir. Çok önemli bir endüstriyel enzim olan glukoamilaz enzimi nişasta, glikojen ve oligosakkaritlerin indirgen olmayan uçlarından glikozidik bağlarını hidrolize ederek D-glukoz üretir. Glukoamilazı endüstri için bu kadar önemli kılan ana neden nişasta proseslerinde oynadığı roldür. Nişasta; gıda, tekstil, deterjan ilaç ve kağıt endüstrisinin ana kaynaklarından biridir. Glukoamilaz doğada; yüksek nişasta hidroliz kapasitesi sayesinde endüstride kullanılan GAI ve GAII olmak üzere iki form halinde bulunur. Birçok bakteri, maya ve fungi çeşitli formlarda glukoamilaz üretebilirler ancak özellikle fungal glukoamilaz endüstri için önem teşkil eder. Bu çalışmada; rekombinant glukoamilaz enziminin Pichia pastoris' de üretilmesi amaçlanmıştır.. Böylece endüstri açısından önemli olan glukoamilaz enzimi laboratuvar ölçeğinde, daha ekonomik ve daha kolay çoğaltılan mayada rekombinant olarak üretilebilecektir. Bu amaçla A.niger' da buunan GAI formundaki glukoamilaz enzimini koldlayan glaA genini taşıyan plasmid dizayn edilmiş ve Pichia pastoris' aktarılmıştır. glaA geninin moleküler klonlanması, dizi analizi ile ve transfeksiyon, koloni PCR ve enzim aktivitesinin belirlenmesi ile doğrulanmıştır. Buna ek olarak elde edilen recombinant enzimin farklı koşullardaki aktivitesi incelenmiştir.
  • [ X ]
    Öğe
    Engineering of a novel 3-dimensional glioblastoma cell culture system
    (Adana Alparslan Türkeş Bilim ve Teknoloji Üniversitesi, 2022) Özdemir, Meryem Damla; Göktürk, Dilek; Peşint, Gözde Baydemir
    Glioblastoma (GBM) oldukça agresif, ölümcül ve kötü prognozludur. GBM için uygulanan tedaviler, tümörün istilacılığı ve heterojenliği nedeniyle sıklıkla başarısız olur. Ayrıca tedavinin ilerlemesini engelleyen, ilaç direnç mekanizmalarından sorumlu pek çok moleküler değişiklik vardır. Bu nedenle, bu mekanizmaların araştırılması ve GBM biyolojisinin anlaşılması, yeni tedaviler geliştirebilmek için çok önemlidir. 3D GBM hücre kültürü modelleri, GBM biyolojisini ve ilaç direnci mekanizmasını incelemek için kullanılabilir. Bu çalışmada GBM'nin ilaç direnç mekanizmasını araştırmak ve tümör biyolojisini anlamak için yeni bir 3D GBM hücre kültürü modeli oluşturulması amaçlanmıştır. Bu amaçla pHEMA-jelatin esaslı kriyojeller, 3 farklı kriyojelasyon sıcaklığında (-12 oC, -16 oC ve -20 oC) ve 3 farklı jelatin konsantrasyonu ile (0.2g, 0.3g, 0.4g) başarıyla sentezlenmiştir. Kriyojeller için karakterizasyon çalışmaları ve in vitro hücre çalışmaları yapılmıştır. Yapılan analizlere göre sentezlenen kriyojellerin tamamı gözeneklilik, şişme özelliği ve biyouyumluluk açısından yapı iskelesi olarak kullanıma uygun bulunmuştur. GBM hücrelerinin ilaç yanıtlarını araştırmak için -16 oC'de 0,4 g jelatin konsantrasyonu ile sentezlenen pHEMA-jelatin bazlı kriyojel, en iyi hücre canlılık sonucunu verdiği için tercih edilmiştir. GBM hücrelerinin, in vivo koşullara benzer şekilde, 2D kültürlenmiş hücrelere göre ilaçlara karşı daha fazla direnç gösterdiği görülmüştür.